La zimografía es una técnica realizada por bioquímicos en la que las partículas se dispersan mediante una carga eléctrica en un proceso conocido como electroforesis. Específicamente, el proceso utiliza un sustrato en el que una enzima reaccionará a través de la polimerización con un gel de policrilamida, una solución a base de agua hecha de materiales tóxicos. Este gel de zimograma se conoce como gel de poliacrilamida con dodecilsulfato de sodio (SDS-PAGE).
Un bioquímico que realiza una zimografía preparará el gel de zimograma utilizando el método de electroforesis. Por lo general, este método se realiza junto con la ebullición o reducción del gel. Sin embargo, en la zimografía, el gel SDS-PAGE se mantiene intacto. Después de este paso, la porción de SDS del compuesto se elimina usando un material conocido como Triton X-100 ™, un detergente de oxidación de la compañía BASF ™. Este material se mantiene a 98 ° F (aproximadamente 37 ° C) durante un período de tiempo en una incubadora avanzada. Luego, un bioquímico teñirá el material restante con un compuesto negro o azul. Esto permite al investigador identificar dónde y cómo se produce la digestión por parte de las enzimas de la sustancia.
Si bien el gel SDS-PAGE es la sustancia más comúnmente utilizada en la zimografía, se pueden usar otros tipos de material para identificar la velocidad de digestión y la capacidad de una enzima. Muchas veces esto incluye la adición de una película de almidón para ayudar al proceso de identificación visual.
Los bioquímicos y los ingenieros biomédicos suelen utilizar este proceso en un esfuerzo por aprender sobre nuevas formas de enzimas. Al definir la tasa de digestión y los patrones de movimiento de una enzima, se pueden identificar las diferentes propiedades de las proteínas humanas y animales. Se utiliza para determinadas investigaciones y análisis genéticos, así como para aplicaciones de fármacos y medicamentos.
El proceso de zimografía debe manejarse con cuidado. Si bien se puede realizar principalmente con mínimas precauciones de seguridad, cualquier científico o investigador que manipule los materiales debe asegurarse de evitar el contacto físico. Tanto el detergente Triton X-100 ™ como el gel SDS-PAGE pueden ser altamente tóxicos para la piel.
Hay una serie de enzimas que no responden como se esperaba a este proceso. Por ejemplo, las glucosidasas digestivas de D. melanogaster pueden sobrevivir a los procesos de reducción en otros tipos de examen digestivo. Además, sobrevivirá al proceso de calentamiento hasta 122 ° F (aproximadamente 50 ° C), muy por encima del nivel necesario en el proceso cimográfico tradicional. Cuando una enzima sobrevive al proceso sin digerir completamente el gel SDS-PAGE, se observa una mayor resolución de banda en las etapas finales. Esto puede causar problemas para obtener resultados correctos del proceso de zimografía.