La marche chromosomique est une méthode de clonage positionnel utilisée pour trouver, isoler et cloner un allèle particulier dans une bibliothèque de gènes. Un allèle est un gène d’un trait génétique particulier transmis des adultes à leur progéniture, comme l’allèle des yeux bruns dans un gène de la couleur des yeux. Parfois, l’emplacement approximatif d’un seul allèle dans une chaîne d’acide désoxyribonucléique (ADN) peut être connu. Pour isoler un allèle particulier pour une maladie génétiquement transmise, la marche chromosomique peut nécessiter d’explorer l’échantillon souhaité dans une séquence d’ADN non cartographiée en dehors des séquences cartographiées précédemment.
Pour localiser un gène de maladie particulier, la marche commence au gène le plus proche qui a déjà été identifié, connu sous le nom de gène marqueur. Chaque gène successif dans la séquence est testé à plusieurs reprises pour ce que l’on appelle les restrictions de chevauchement et cartographié pour leur emplacement précis dans la séquence. Finalement, la marche à travers les gènes atteint le gène mutant dans une séquence non cartographiée qui se lie à un fragment d’un gène de cette maladie particulière. Une fois le gène cloné, sa fonction peut être entièrement identifiée. Tout au long de ce processus, des tests sont effectués pour identifier pleinement les propriétés de chaque clone successif, pour cartographier leurs emplacements pour une utilisation future.
Il existe près d’une demi-douzaine de tests de clonage positionnel qui sont effectués avant une promenade chromosomique, pour affiner autant que possible les séquences génétiques particulières qui peuvent contenir le gène mutant souhaité pour une maladie. Une fois que les marqueurs de chaque côté d’une séquence probable non cartographiée sont trouvés, la marche chromosomique peut commencer à partir de l’un des marqueurs. Les tests sur chaque clone successif sont complexes, longs et variés selon les espèces. Il existe des tests différents pour les gènes liés aux maladies des plantes que pour les gènes impliqués dans une bibliothèque de gènes humains.
Le clonage positionnel utilise des marqueurs génétiques connus pour habiter les chromosomes d’individus atteints de maladies spécifiques. Ces bases de données de traits communs connus permettent des tests qui peuvent être utilisés pour identifier les individus qui peuvent ou non avoir certains gènes récessifs pour une maladie qui ne s’est pas encore présentée. La marche chromosomique, ainsi que tous les autres tests effectués avant la marche chromosomique, nécessitent des laboratoires exceptionnellement bien équipés pour effectuer toutes les phases de clonage, les examens et l’analyse des mutations trouvées.