Bien que l’Alabama soit devenu un État en 1819, l’histoire de son drapeau d’État n’a commencé qu’en 1861, lorsque la décision de se séparer de l’Union a été prise. En janvier 1861, lors de la convention de sécession, le premier drapeau de l’État de l’Alabama a été adopté par les délégués. Ce drapeau n’a été utilisé que quelques semaines; en mars 1861, l’Alabama a plutôt commencé à utiliser le premier des deux drapeaux confédérés comme le sien. En 1865, après la fin de la guerre civile, le drapeau des États-Unis est devenu le drapeau officiel de l’Alabama. Enfin, en 1891, l’Alabama a conçu et finalement adopté un drapeau unique qui a survolé l’État depuis lors.
Le drapeau de l’État de l’Alabama de 1861 a été conçu à Montgomery par un petit groupe de femmes. D’un côté du drapeau, la figure de la déesse de la liberté était affichée tenant une épée dans une main et un drapeau plus petit avec une seule étoile dans l’autre ; les mots Indépendant maintenant et pour toujours sont apparus au-dessus de la figure. L’autre côté avait un serpent à sonnettes enroulé avec un cotonnier avec les mots « Touch Me Not » sous cette représentation. Ce drapeau est parfois appelé drapeau de la Convention de sécession ou drapeau de la République d’Alabama. Environ un mois après son adoption comme drapeau de l’État de l’Alabama, une violente tempête l’a endommagé et le drapeau a été retiré et n’a plus jamais volé.
Peu de temps après le retrait du premier drapeau de l’Alabama, l’État a choisi d’utiliser le drapeau national confédéré. Lors d’occasions officielles, le premier drapeau national ou le deuxième drapeau national de la Confédération ont été hissés. Une fois la guerre civile terminée en 1865, ces drapeaux ont été retirés et l’Alabama a recommencé à utiliser le drapeau des États-Unis.
L’Alabama a utilisé le drapeau des États-Unis jusqu’en 1891, date à laquelle un nouveau design pour un drapeau d’État a été commandé. Enfin, en 1895, un nouveau drapeau a été approuvé par la législature, qui reste aujourd’hui le drapeau de l’État de l’Alabama. La conception approuvée a été calquée sur le drapeau de la bataille confédérée et est devenue le deuxième drapeau officiel de l’Alabama.
De tous les 50 drapeaux d’État, celui de l’Alabama est l’un des plus simples à concevoir. Tel que promulgué par la loi, le drapeau de l’Alabama est une croix cramoisie de Saint-André placée contre un champ blanc. Les couleurs utilisées dans le drapeau représentent le courage et la pureté, tandis que la croix reflète une partie de la conception du drapeau de la bataille confédérée. Puisque la législation ne dicte pas si le drapeau doit être rectangulaire ou carré, il est vu dans les deux sens.