Die Staatsflagge von Idaho durchlief drei verschiedene Versionen, da die ersten beiden die gesetzlichen Anforderungen nicht ganz erfüllten. Die erste Flagge wurde 1907 in Auftrag gegeben, aber die ursprünglichen Spezifikationen entsprachen nicht den gesetzlichen Bestimmungen. Die Statuten wurden 1927 überarbeitet, um klarzustellen, dass das vollständige Staatssiegel auf der Flagge enthalten sein sollte, aber einige Elemente des Designs waren immer noch nicht standardisiert. 1957 wurde eine verbesserte Version des Staatssiegels genehmigt und Fragen zum Siegel geklärt. Das Design der Flagge basierte auf einem früheren Militärbanner.
Wie bei vielen anderen Staatsflaggen entstand die Staatsflagge von Idaho als Militärbanner. Im Jahr 1898 schickte Idaho zwei Bataillone in den Spanisch-Amerikanischen Krieg. Kurz bevor diese Männer zum Kampf aufbrachen, wurde ihnen eine Flagge von den Frauen von Idaho überreicht. Das Regiment trug diese Flagge während des ganzen Krieges; es ist derzeit in der Hauptstadt von Idaho ausgestellt.
Diese erste Flagge wurde von Colonel Charles H. Irvin entworfen und von Nadelarbeitern in Chicago hergestellt. Es war aus militärblauer Seide mit dem Siegel des Staates Idaho, das mit farbigen Seidenfäden in der Mitte aufgestickt war. An drei Seiten der Flagge befindet sich ein goldener Rand.
Im Jahr 1907 beschloss der Gesetzgeber von Idaho, eine offizielle Staatsflagge zu schaffen, und wählte ein Design, das dem Militärbanner sehr ähnlich war. Es war die Aufgabe des Generaladjutanten von Idaho, diese Flagge zu schaffen. Die einzige wesentliche Änderung der Flagge bestand darin, dass die neue Flagge anstelle des Regimentsnamens den Staatsnamen enthalten sollte.
Die Abmessungen der ersten Flagge waren 5 Meter breit und 6 Meter hoch. Der Rand war 1.67 Zoll (4 cm) breit und das Staatssiegel hatte einen Durchmesser von 4 Zoll (1.32 cm) und befand sich in der Mitte der Flagge. Die Buchstaben für den Ausdruck „State of Idaho“ waren 2.5 cm hoch auf einem roten Band, das 6.35 cm lang und 21 cm hoch war. Das Band wurde 53.34 Zoll (2 cm) über dem unteren Rand der Flagge angebracht.
Die Vorgaben des Generaladjutanten waren tatsächlich anders als im Gesetz von 1907. Der Hauptunterschied bestand darin, dass nicht das gesamte Staatssiegel verwendet wurde, sondern nur Bildinformationen ohne Worte. 1927 wurden die Vorgaben des Generaladjutanten in das Gesetz aufgenommen und ersetzten die Vorgaben aus dem Statut von 1907. Die Kontroverse über die Staatsflagge von Idaho dauerte bis 1957 an, alle basierten auf der Darstellung des Staatssiegels. In diesem Jahr genehmigte der Gesetzgeber des Bundesstaates eine neue Version des Staatssiegels, das ab diesem Zeitpunkt auf der Staatsflagge von Idaho verwendet wurde.
Bilder auf dem Siegel der Staatsflagge von Idaho repräsentieren die wichtigsten Wirtschaftszweige des Staates: Forstwirtschaft, Landwirtschaft und Bergbau. Der Bergmann auf dem Siegel steht für Bodenschätze und Bergbau. Das Obst und Gemüse und die Weizengarbe repräsentieren die Landwirtschaft. Eine einsame Kiefer repräsentiert die Holzindustrie und ein Elch repräsentiert Wildtiere aus der Forstwirtschaft.