Eine interne Organisationsstruktur ist die besondere Art und Weise, in der eine Organisation wie ein Unternehmen, eine Wohltätigkeitsgruppe oder eine Schule organisiert ist, um ihre Ziele zu erreichen. Diese Organisationsstruktur umfasst die Zuweisung von Aufgaben, die Aufsichtsstruktur, die Hierarchie und andere Belange, die sich auf die Art und Weise, in der die Organisation funktioniert, auswirken. Sie kann je nach Art und Zielen der Organisation variieren und kann sich auch aufgrund der Vorlieben und Ideale der Verantwortlichen unterscheiden. So kann beispielsweise ein internes Organisationsstruktursystem auf einer strengen hierarchischen Kontrollstruktur basieren, während ein anderes weitaus weniger beaufsichtigt werden kann. Das erste Ziel ist wahrscheinlich Stabilität und Effizienz, während das zweite wahrscheinlich den Schwerpunkt auf Kreativität und Flexibilität legt.
Die interne Organisationsstruktur der meisten Organisationen basiert hauptsächlich auf der Anordnung und Gruppierung von Personal, um Aufgaben zu erfüllen. Eine stark hierarchische Struktur ist beispielsweise durch „Ränge“ gekennzeichnet, in denen Vorgesetzte das Handeln ihrer Untergebenen auf die Unternehmensziele ausrichten. Personen mit höherem Rang beaufsichtigen und weisen ihren Untergebenen Aufgaben zu. Diese Struktur unterstützt die primäre Art und Weise, in der Aufgaben erfüllt werden, die letztendlich zu den Zielen des Unternehmens beitragen.
Einige Organisationen haben Abteilungen, die sich speziell der Aufrechterhaltung und Durchsetzung der internen Organisationsstruktur widmen, indem sie zusätzliche Mitarbeiteraufsicht bieten und Aufgaben verfolgen, die nicht direkt mit den Zielen des Unternehmens zusammenhängen. So trägt beispielsweise eine Personalabteilung oder eine Lohnbuchhaltung nicht direkt zur Produktivität einer Fabrik bei, aber sie tragen dazu bei, dass das interne Organisationssystem reibungslos funktioniert. Solche Abteilungen können wichtige logistische Anliegen bearbeiten, damit diejenigen, die direkt an der Aufrechterhaltung oder Verbesserung der Produktivität eines bestimmten Unternehmens beteiligt sind, nicht davon abgelenkt werden.
Viele andere Formen der internen Organisationsstruktur als die hierarchische Organisation haben sich als sehr effektiv erwiesen, um eine Vielzahl unterschiedlicher institutioneller Ziele zu erreichen. Einige Organisationen basieren beispielsweise auf kleinen „Teams“, die über ein hohes Maß an Autonomie verfügen und nicht ständig einem Vorgesetzten Bericht erstatten müssen. Einige erlauben sogar ein hohes Maß an persönlicher Autonomie, obwohl ein gewisses Maß an Rechenschaftspflicht fast immer erforderlich ist. Das Internet hat die Entwicklung von Organisationsstrukturen ermöglicht, die hauptsächlich online existieren. Im Allgemeinen basieren die besten Organisationsstrukturen in erster Linie auf den Zielen der Organisation.