Eine niedrige Basaltemperatur ist typischerweise ein Messwert unter etwa 96°F (35.6°C). Die Temperatur sollte in Ruhe direkt nach dem Aufwachen gemessen werden, damit sie genau ist. Das Ergebnis zeigt den Stoffwechsel der Person an, sodass eine niedrige Körpertemperatur auf eine Hypothyreose hinweisen kann, die oft zu Nebenwirkungen wie trockener Haut, Depression und Müdigkeit führt. Für die meisten Frauen gilt dies jedoch zumindest für einen Teil des Monats als normal, da der Körper vor dem Eisprung als Teil des zweiphasigen Musters zu einer niedrigeren Temperatur neigt. Dies tritt tendenziell während der Menstruation auf – in diesem Fall könnte man sagen, dass die typischen Auswirkungen einer niedrigen Temperatur vaginale Blutungen, Müdigkeit und Stimmungsschwankungen umfassen – obwohl die niedrige Temperatur eher eine Folge hormoneller Veränderungen ist als ein Zustand, der andere Auswirkungen verursacht.
Manche Menschen messen ihre Basaltemperatur regelmäßig, normalerweise indem sie jeden Morgen vor dem Aufstehen ein Thermometer verwenden. Die Messung der Temperatur jeden Tag zur gleichen Zeit führt zu den genauesten Ergebnissen, und die meisten Mediziner empfehlen, dass Patienten die Temperatur mindestens drei Tage hintereinander aufzeichnen, um ein Muster zu erkennen. Dies liegt daran, dass eine zufällig niedrige Temperatur möglicherweise nicht viel bedeutet oder das Ergebnis einer besonders kalten Nacht ist, aber Temperaturen, die ständig unter dem Durchschnitt liegen, können auf ein Gesundheitsproblem hinweisen. Da beispielsweise der Stoffwechsel durch die Anzahl der Hormone bestimmt wird, die die Schilddrüse freisetzt, kann eine niedrige Basaltemperatur auf eine Hypothyreose hinweisen.
Eine Schilddrüsenunterfunktion verursacht eine Reihe von Symptomen, aber viele Menschen werden nicht diagnostiziert, da die Auswirkungen oft auf andere Probleme zurückgeführt werden. Viele Patienten klagen beispielsweise über Kopfschmerzen, trockene Haut, Depressionen, Müdigkeit, Gewichtszunahme und Kälteempfindlichkeit. Frauen mit Hypothyreose können auch unregelmäßige Menstruationszyklen bemerken. Wenn dieser Zustand jahrelang unbehandelt bleibt, können die Patienten unter verlangsamter Sprache, dicker Haut und der Unfähigkeit, wie gewohnt zu schmecken oder zu riechen, leiden.
Für viele Frauen ist eine niedrige Basaltemperatur jedoch normal, solange sie nur etwa den halben Monat dauert. Dies liegt daran, dass der Menstruationszyklus ein zweiphasiges Muster verwendet, bei dem die Körpertemperatur in den ersten zwei Wochen des Zyklus niedrig und in der zweiten Hälfte höher ist. Ein hoher Östrogenspiegel ist in der Regel vor dem Eisprung schuld, weshalb die Temperatur kurz nach dem Eisprung ansteigt, wenn Progesteron übernimmt. Daher kann eine niedrige Temperatur sowohl von vaginalen Blutungen als auch von Symptomen des prämenstruellen Syndroms (PMS) wie Müdigkeit, Stimmungsschwankungen und Blähungen begleitet sein.