En climas fríos, generalmente se necesita un método confiable de calentamiento de invernadero para proteger las plantas delicadas de las temperaturas bajo cero. El mejor método de calefacción de invernadero generalmente depende de la disponibilidad de una fuente de energía, el tipo de planta y el tamaño de la estructura. Las bandejas y almohadillas para calentar el suelo son a menudo la mejor manera de mantener calientes las plántulas pequeñas durante los meses de invierno, pero generalmente no son rentables para estructuras más grandes. Los calentadores de propano son un método de bajo costo para calentar el invernadero, pero no son adecuados para todas las variedades de plantas debido a las emisiones de escape nocivas. Los calentadores eléctricos son a menudo la primera opción para la calefacción de invernadero debido a su bajo costo operativo, eficiencia y facilidad de uso.
Las bandejas para calentar el suelo funcionan de la misma manera que una manta eléctrica al utilizar una red de cables calefactores aislados para producir un calor suave. Estos cables calefactores están situados debajo del suelo cerca del fondo de la bandeja y generalmente controlados por un termostato. Las almohadillas de calentamiento funcionan de manera similar, pero se colocan debajo de las bandejas de plántulas. Las bandejas y almohadillas para calentar el suelo requieren una fuente de electricidad cercana, y es posible que se necesite un circuito separado para alimentar varias unidades. Estos dispositivos suelen ser un método de calentamiento de invernadero económico para estructuras pequeñas.
El propano también es un buen método de calentamiento de invernadero debido a su calor húmedo y bajo costo operativo. Sin embargo, el calor húmedo producido por las unidades de propano a veces puede crear condensación o problemas de moho, y también puede ser necesario un deshumidificador. Los calentadores de propano a veces permiten que se formen puntos fríos en áreas de mala circulación de aire, y es posible que se necesite un ventilador para una distribución uniforme del calor. Estas unidades generalmente no están equipadas con un termostato y pueden hacer que el invernadero se sobrecaliente en ocasiones. Los gases producidos por los calentadores de propano son dañinos para ciertas especies de plantas y también puede ser necesario un método de ventilación por extracción.
Un calentador eléctrico suele ser el método de calefacción de invernadero más popular debido a su distribución uniforme del calor y su costo operativo relativamente bajo. Esta variante de calentador generalmente es forzada por ventilador, y una sola unidad puede hacer circular aire caliente a través de una estructura pequeña en un corto período de tiempo. Los calentadores eléctricos están controlados por termostato para permitir su funcionamiento solo cuando la temperatura desciende por debajo de cierto nivel. Estos calentadores producen una forma de calor muy seca y también puede ser necesario un humidificador para evitar daños a la vegetación sensible. Los calentadores eléctricos deben diseñarse específicamente para uso en invernaderos; una unidad doméstica ordinaria nunca debe usarse para este propósito.