Un contig, abreviatura de contiguo, se refiere a un segmento de ácido desoxirribonucleico (ADN) o al producto de segmentos superpuestos que forman una secuencia de ADN continua, extensa e ininterrumpida. Al estudiar mapas de estos segmentos, es posible descubrir el orden de los segmentos que comprenden varias secuencias, y se pueden agregar, eliminar o reorganizar contigs para formar nuevas secuencias. El mapeo y las bibliotecas de ADN contig permiten a los investigadores identificar alineaciones que podrían causar enfermedades, proporcionan una mejor comprensión de cómo reaccionan las células en determinadas condiciones y permiten la capacidad de clonar características favorables en organismos vivos.
Los contigs genómicos están conectados entre sí mediante la superposición de conjuntos etiquetados de secuencia coincidente o mediante etiquetas de secuencia expresadas coincidentes. Al comprender este proceso de bloques de construcción utilizado por las bases de los segmentos de ADN, los contigs pueden replicarse o clonarse en secuencias deseables, agregando o eliminando segmentos menos favorables. Los investigadores ven estas secuencias como mapas en programas de ADN computarizados altamente detallados. El programa proporciona un desglose visual de las bases utilizadas para construir los segmentos y los segmentos utilizados para construir secuencias particulares. Utilizando diferentes esquemas de color, varios programas contig muestran esta información como secuencias de calidad baja, media y alta.
El mapeo contig arroja luz con frecuencia sobre las causas de los trastornos genéticos. El síndrome de Williams, por ejemplo, produce síntomas multisistémicos en los niños, incluidos problemas cardiovasculares, niveles elevados de calcio en sangre y retraso del crecimiento. Los investigadores descubrieron deleciones de bandas que afectan a ciertos genes, que pueden ser causadas por una superposición inapropiada de contigs. Otro trastorno genético de la infancia, el síndrome cri-du-chat, también produce múltiples síntomas, cada uno de los cuales los científicos creen que se correlacionan con deleciones y posiciones anormales.
Los investigadores también analizan secuencias de contig en especies de plantas. Cada planta contiene una secuencia única para esa planta, y al obtener mapas de especies de plantas individuales, los científicos descubren características similares y variables que pueden contribuir a la salud o al deterioro de un tipo de planta en particular. Al analizar los segmentos y secuencias contig en organismos portadores de enfermedades, los médicos pueden determinar rasgos que luego pueden usarse en el desarrollo del tratamiento. El mapeo proporciona una visión visual de las posibles manipulaciones genéticas a través de la eliminación de secuencias o la clonación.
Los científicos pueden cultivar muestras de ADN clonado en cromosomas artificiales bacterianos, cromosomas artificiales de levadura o en medios cromosómicos artificiales P1 o fagos. Estos cromosomas contienen entre 50 y cientos de miles de bases, que compilan segmentos contig. Después de un período de colonización, las muestras se extraen con una jeringa y se colocan en un gel de secuenciación de ADN, que se somete a electroforesis y se seca. Una autorradiografía lee la muestra y toma las huellas dactilares de las secuencias. Luego, los investigadores escanean la huella digital en un archivo de imagen, que luego se puede cargar en un programa contig.