Le système lymphatique et le système immunitaire sont deux systèmes corporels distincts, mais sont étroitement liés de plusieurs manières. Le système immunitaire existe dans tout le corps, mais la majorité de ses composants actifs se déplacent le long de la voie physique du système lymphatique. Sans vaisseaux lymphatiques, les diverses fonctions du système immunitaire seraient rendues presque inutiles. Une grande partie des défenses du corps repose sur les globules blancs et la libération d’oxygène supplémentaire filtrée par le système lymphatique. Ces cellules sont transportées vers la zone nécessaire pour combattre les particules considérées par le système immunitaire comme étrangères et éventuellement dangereuses.
La connexion entre le système lymphatique et le système immunitaire peut d’abord être observée dans l’un des organes secondaires du système lymphatique, le ganglion lymphatique. Toute protéine, comme celles codées dans un virus de la grippe ou présentes dans les coquillages, peut être considérée par l’organisme comme un antigène. Les allergies aux animaux peuvent généralement être attribuées à la présence d’une protéine indésirable, comme c’est le cas avec une réaction allergique aux chats, car les squames félines contiennent de grandes quantités de protéines spécifiques. Les ganglions lymphatiques obtiennent l’antigène par le système circulatoire par le biais des voies lymphatiques, puis « introduisent » l’antigène dans les cellules naïves du système immunitaire, comme les cellules T CD4, pour lancer le processus de formation d’une réponse immunitaire intelligente à la substance. Les ganglions lymphatiques ont également une forte concentration de macrophages du système immunitaire, ou de cellules qui digèrent les matières indésirables, aidant à purifier le sang et la lymphe elle-même.
Les lymphocytes, connus pour être importants à la fois dans le système lymphatique et le système immunitaire, sont un type de globule blanc générique qui peut être différencié par le corps pour des tâches spécifiques à médiation immunitaire. Les lymphocytes se développent dans la moelle osseuse, en particulier dans les os longs du corps, comme le fémur. Certains des lymphocytes migrent vers le thymus et sont séparés en cellules T qui identifient, attaquent directement ou détruisent les agents pathogènes de diverses autres manières, selon le type exact de cellule T que devient le lymphocyte. Les lymphocytes peuvent également être divisés en cellules B alors qu’ils sont encore dans la moelle osseuse. Lors de la maturation, les cellules B contribuent au système lymphatique et au système immunitaire en produisant et en expédiant des anticorps pour combattre les particules infectieuses déjà reconnues dans tout le corps.
Les allergies à des choses comme la poussière, les moisissures et le pollen sont également médiées par le système lymphatique et le système immunitaire. Après exposition à la substance irritante, les personnes allergiques produisent des anticorps, des lymphocytes T et des lymphocytes B qui y sont sensibles. Les anticorps se lient aux mastocytes, un autre type de globule blanc, qui produit de l’histamine, responsable de la plupart des symptômes allergiques apparents.