Embora haja muitas desvantagens potenciais e muitas pessoas não tenham certeza se essa prática é moralmente correta ou não, as vantagens da clonagem são inúmeras. Certos tipos de clonagem podem ser usados para criar fontes de alimentos com um valor nutricional mais alto, enquanto outros podem ser usados para criar tipos de medicamentos ou tratamentos. Uma das vantagens mais conhecidas da clonagem é o transplante de órgãos, que pode potencialmente salvar a vida de vítimas de acidentes e de quem espera a doação de órgãos.
Os benefícios médicos da clonagem podem começar com a nutrição real do corpo. Não apenas vacas e galinhas clonadas podem produzir mais ovos e leite, mas os cientistas também podem alterar geneticamente o valor nutricional desses alimentos. Bebês incapazes de amamentar também podem se beneficiar de certos tipos de clonagem de animais. Por exemplo, uma vaca cujo código genético é manipulado pode produzir leite que contém proteínas semelhantes às encontradas no leite materno humano.
A fertilidade é outra das possíveis vantagens da clonagem. Para aqueles que são estéreis, esta solução pode fornecer esperança onde outras opções falharam. Um dos processos mais comuns de clonagem reprodutiva começa com a injeção do material genético de um dos pais em um óvulo. Feito isso, o óvulo é estimulado por eletricidade ou produtos químicos e, em seguida, colocado no útero. Embora esse processo tenha sido realizado em algum grau em animais, mais pesquisas são necessárias para ver se ele também funcionará ou não para humanos.
Além da nutrição e da fertilidade, os benefícios da clonagem chegam ao tratamento e, possivelmente, à cura de muitos problemas médicos. O transplante de órgãos é o uso médico mais conhecido para clonagem. Às vezes, órgãos transplantados são colhidos de animais, que são regularmente rejeitados por receptores humanos. Animais clonados, no entanto, podem ter genes humanos, o que pode tornar a rejeição menos comum. A clonagem também pode ser benéfica na substituição de ossos, cartilagens e pele em vítimas de queimaduras e acidentes.
Outras vantagens médicas da clonagem consistem na criação de medicina avançada. Esses medicamentos podem ser usados para tratamentos de coração e medula óssea, para controlar diabetes e artrite reumatóide e talvez até mesmo para curar problemas renais e doença de Parkinson. Além disso, a clonagem também pode ser capaz de curar certos tipos de câncer, substituindo genes mutantes por genes normais e saudáveis. Esse processo geralmente consiste em retirar células do sistema imunológico do próprio corpo do paciente, duplicá-las e, em seguida, colocá-las de volta no sistema.