Os porquinhos-da-índia sofrem de muitas das mesmas doenças que atingem outros mamíferos, incluindo os humanos. Pneumonia, doenças de pele e parasitas estão entre as doenças mais comuns da cobaia. Porquinhos da Índia também são muito suscetíveis a insolação. Em muitos casos, eles não demonstram desconforto até que a doença ou condição esteja bem estabelecida; é importante que os donos de cobaias estejam cientes dos sintomas e levem seus animais de estimação para exames veterinários regulares.
Um porquinho-da-índia que consome uma dieta abaixo do padrão e vive em uma gaiola suja provavelmente desenvolverá pneumonia como resultado de uma infecção bacteriana respiratória. Os sintomas incluem narinas ou olhos que estão drenando líquidos e se recusam a comer. Um porquinho-da-índia que está respirando rapidamente e não se move dentro ou fora da gaiola deve ser levado imediatamente ao veterinário, ou a morte é o resultado provável.
Um distúrbio cutâneo provavelmente está presente em porquinhos-da-índia que se coçam e mordiscam a si mesmos, perdem pêlos a ponto de ficarem calvos ou exibem pele vermelha ou irritada. A menos que um animal seja visto por um veterinário, a irritação da pele pode desenvolver uma crosta fétida ou ficar espessa. As doenças da pele de cobaias podem ser o resultado de dieta insuficiente, doença subjacente ou parasitas. Os tratamentos incluem ivermectina, xampus medicamentosos e pós ou unguentos seguros para porquinhos-da-índia aplicados nas áreas afetadas.
Muitos parasitas se alimentam de cobaias. As ciccoidoses, disseminadas por um parasita unicelular, causam diarréia grave. Os piolhos, que também procuram hospedeiros humanos, são responsáveis por manchas carecas e feridas abertas. A micose, um parasita humano, causa calvície no nariz e na cabeça, além de irritar a pele de porquinhos-da-índia.
Os proprietários de cobaias devem estar cientes de que uma deficiência de vitamina C geralmente contribui para doenças de cobaias. Os animais que parecem fracos ou exaustos, sangram das gengivas ou apresentam dentes deformados precisam de intervenção veterinária. Injeções, suplementos e uma mudança na dieta que inclui muitos alimentos ricos em vitamina C podem reverter a condição.
Outras doenças da cobaia que são mais comuns em animais mais velhos incluem cistos ovarianos e alguns tipos de câncer. Cerca de três quartos das fêmeas de cobaias há mais de um ano e meio têm cistos ovarianos. Certos padrões de perda de pele, bem como uma diminuição da fertilidade, podem indicar que a doença está presente. O ultrassom é a ferramenta de diagnóstico de escolha, e a castração de um animal de estimação doente é o tratamento mais comum.
Uma baixa porcentagem de porquinhos-da-índia desenvolve câncer, e aqueles que o fazem geralmente são animais de estimação mais velhos. Os cânceres de pele, mama e sangue são mais comuns que outros tipos. O tratamento pode ser realizado para tornar o animal mais confortável.
Porquinhos da Índia são altamente suscetíveis a insolação. A condição exibe sintomas que incluem baba, gengivas pálidas e ofegantes. A insolação progride rapidamente para a morte se o animal afetado não for tratado imediatamente.