Nebenwirkungen von L-Carnitin sind selten. Wenn jedoch Symptome auftreten, bemerken Betroffene oft leichte bis mittelschwere Magen- und Verdauungsbeschwerden, Kopfschmerzen und Hautreizungen. Bei einigen treten Blasenentzündungen, Schlafstörungen und ein ungewöhnlicher Körpergeruch auf.
Als Derivat der Lysin-Aminosäure hilft L-Carnitin beim Fettstoffwechsel. Die Unterstützung, die es bietet, ist für eine gute Gesundheit von entscheidender Bedeutung, da es Fettsäuren direkt an die Zellmitochondrien liefert. Sofern eine Person keinen Mangel an diesem Aminosäurederivat hat, besteht im Allgemeinen keine Notwendigkeit, seine Präsenz im Körper zu erhöhen. Obwohl es durch den Verzehr von Milchprodukten und rotem Fleisch leicht zugänglich ist, kaufen viele Menschen, die diese Lebensmittel meiden, es stattdessen in Form von Nahrungsergänzungsmitteln und sind oft neugierig auf bekannte Nebenwirkungen von L-Carnitin.
Auch Personen, die an Hämodialyse und altersbedingtem Gedächtnisverlust leiden, können von L-Carnitin profitieren. Forscher sind sich jedoch nicht sicher, ob eine Ergänzung dieser Aminosäure solche Verluste tatsächlich verhindert. Da Schlafstörungen eine der selten berichteten Nebenwirkungen von L-Carnitin sind, empfinden Personen, die es einnehmen, um den Gedächtnisverlust zu verlangsamen, es oft als weniger wirksam.
Nebenwirkungen, die manchmal einfach als Carnitin oder Acetyl-L-Carnitin bezeichnet werden, werden bei gesunden Personen sehr selten berichtet. Bei Menschen mit anderen gesundheitlichen Problemen werden, wenn überhaupt, nur wenige Nebenwirkungen festgestellt. Tatsächlich ist bei einigen HIV-Patienten bekannt, dass antivirale Medikamente zur Behandlung von HIV-Infektionen tatsächlich einen Mangel an L-Carnitin verursachen. Nebenwirkungen wie diese werden häufig mit Carnitin-Supplementierung behandelt, die dazu beiträgt, ein gesundes Niveau davon im Körper wiederherzustellen.
Auch wenn die meisten Menschen keine Nebenwirkungen von L-Carnitin haben, berichten diejenigen, die Probleme haben, in der Regel über leichte bis mittelschwere Symptome und Störungen wie Hautausschlag, verstopfte Nase, Übelkeit, Durchfall und Erbrechen. Mehrere haben sogar über das Vorhandensein eines eigenartigen Körpergeruchs berichtet, der möglicherweise auf chemische Wechselwirkungen mit dem Nahrungsergänzungsmittel im Körper zurückzuführen ist. Während Körpergeruch eine der weniger häufigen Nebenwirkungen von L-Carnitin ist, haben Forscher herausgefunden, dass er durch die Einnahme von Riboflavin-Ergänzungen vermieden werden kann.
Auch wenn keine offensichtlichen körperlichen Nebenwirkungen von L-Carnitin vorliegen, empfehlen Ärzte, dass Personen, die Carnitin-Ergänzungen einnehmen, sich auch regelmäßig einer klinischen Untersuchung unterziehen. Dies liegt daran, dass einige Nebenwirkungen von L-Carnitin erst durch medizinische Tests entdeckt werden. Forscher, die Kinder mit Aufmerksamkeitsstörungen testen, haben auch festgestellt, dass eine L-Carnitin-Supplementierung einigermaßen wirksam ist, empfehlen jedoch, eine solche Behandlung nur unter ärztlicher Aufsicht durchzuführen, damit Nebenwirkungen genau überwacht und behandelt werden können, falls sie auftreten.