La ecología acuática es una rama de la ciencia de la ecología que se ocupa del estudio de los ecosistemas acuáticos. Este campo se puede dividir en dos divisiones: ecología de agua dulce y ecología marina. Dado que la mayor parte de la Tierra está cubierta de agua, comprender los ecosistemas acuáticos es muy importante, especialmente porque el agua es fundamental para la supervivencia de toda la vida en la Tierra. Sin agua, la Tierra sería un lugar muy diferente y probablemente no habría ningún ecólogo para estudiarlo.
La ecología del agua dulce involucra ríos, lagos, arroyos, cuerpos de agua estacionales, depósitos de agua subterránea y las áreas circundantes, mientras que la ecología marina se ocupa del océano. Los estuarios, donde el agua dulce se encuentra con el agua salada, pueden ser estudiados por ecologistas de cualquiera de los campos, y en ocasiones de ambos, trabajando cooperativamente en proyectos que requieren la experiencia de ecologistas marinos y de agua dulce. Debido a que los sistemas de agua están interconectados, existe una gran cooperación entre los profesionales que trabajan en varios aspectos de la ecología acuática y entre los ecólogos acuáticos y otros miembros de la profesión de la ecología.
Ya sea que un ecologista trabaje con agua salada o dulce, hay una serie de temas de interés en la ecología acuática. Los ecólogos acuáticos estudian las poblaciones naturales de organismos en el agua y aprenden sobre las variaciones naturales y el impacto de influencias como la temperatura, la salinidad, la profundidad del agua, la ubicación y la estación. Los ecologistas pueden estar interesados específicamente en organismos de importancia económica o en la biología de un ecosistema en su conjunto.
Los ecologistas acuáticos también están interesados en las interacciones humanas con el medio ambiente y el impacto de la actividad humana en los ecosistemas acuáticos, que van desde derrames de petróleo en el océano hasta escorrentías agrícolas en lagos y arroyos. Algunas actividades humanas tienen consecuencias no deseadas, y estas consecuencias pueden adquirir una escala épica en el mundo de la ecología acuática, ya que toda el agua finalmente se drena al océano y todos los océanos del mundo están conectados. Un microbio en el Ganges puede terminar en un puerto en Gran Bretaña, y los ecologistas pueden explorar el camino que tomó el microbio para llegar allí, y si las actividades humanas jugaron un papel o no.
Hay una gran cantidad de campos de estudio disponibles para las personas que trabajan en ecología acuática, incluida la conservación del agua, la preservación del medio ambiente, los usos comerciales de los recursos acuáticos, la contaminación, la historia del uso del agua, las políticas de uso del agua y el estudio de organismos únicos en varios ambientes acuáticos en todo el mundo. Las personas generalmente ingresan a este campo obteniendo una licenciatura en ecología, enfocándose en temas acuáticos de interés, y algunos persiguen una capacitación avanzada en la escuela de posgrado para recibir calificaciones y experiencia adicionales.