Un ligand est une mol?cule d?clenchant un signal qui s’adapte ? des sites prot?iques r?cepteurs sp?cifiques situ?s sur les parois cellulaires du corps des organismes vivants. Lorsqu’un ligand s’ins?re dans son site prot?ique sp?cifique, il modifie la forme physique de la prot?ine. Ce changement dans la forme de la prot?ine r?ceptrice pourrait alors activer ou inhiber un autre m?canisme biologique li? ? cette interaction sp?cifique. La mani?re dont le ligand et la prot?ine s’assemblent et leur produit r?sultant sont appel?s interactions prot?ine-ligand.
Les interactions prot?ine-ligand sont tr?s compliqu?es. Toutes les mol?cules sont maintenues ensemble par de fortes forces ?lectroniques qui les entourent dans leur configuration tridimensionnelle dans l’espace. Ces forces peuvent repousser ou attirer d’autres mol?cules, selon leur structure ?lectronique. Les mol?cules biologiques agissent souvent comme des aimants de charges similaires ou de charges oppos?es, se repoussant ou s’attirant.
De plus, la configuration physique r?elle des mol?cules biologiques affecte leur ajustement et la pr?cision de l’ajustement. Certaines mol?cules biologiques sont flexibles et se plieront dans leur environnement, et d’autres sont plus rigides. Chaque r?cepteur poss?de ?galement un site actif, qui est le point sp?cifique qui d?clenche le changement biologique. L’emplacement de ce site actif est important pour d?terminer la probabilit? qu’il s’active. Les ligands et les prot?ines interagissent tout en flottant ? la surface des cellules du corps, de sorte que l’ajustement ne sera pas toujours direct, comme une cl? s’ins?re dans une serrure.
La compr?hension des interactions prot?ine-ligand est vitale pour la cr?ation de nouveaux m?dicaments th?rapeutiques pour traiter la maladie, ainsi que pour la compr?hension des causes biologiques de la maladie elle-m?me. Pour le chercheur int?ress? par les interactions ligand-prot?ine pour le d?veloppement de m?dicaments, des facteurs suppl?mentaires doivent ?tre pris en compte. Certaines de ces consid?rations incluent l’?tude de l’efficacit? du nouveau m?dicament ? se lier ? la prot?ine r?ceptrice d’int?r?t, les effets secondaires potentiels et le m?canisme par lequel le corps d?compose le m?dicament.
Il existe de nombreuses m?thodes chimiques et informatiques disponibles pour ?tudier ces interactions, toutes bas?es sur la recherche de la forme et de la charge compl?mentaires du ligand pour le r?cepteur que le chercheur souhaite modifier sur le plan comportemental. Les programmes de conception assist?e par ordinateur sont couramment utilis?s pour ?tudier les interactions prot?ine-ligand et d?velopper de nouveaux m?dicaments pour le traitement des maladies humaines. Ceci est possible car de nombreux traits physiques et chimiques des mol?cules sont bien connus, tels que leurs structures ?lectroniques.