Mutações no gene da protrombina, conhecidas como mutações do fator II, são geneticamente relacionadas e, portanto, são adquiridas por herança. Esse gene é responsável pela produção de protrombina, que é convertida em trombina in vivo; portanto, esse defeito às vezes é conhecido como mutação no gene da trombina. A trombina, por sua vez, converte o fibrinogênio solúvel em água em uma molécula insolúvel, a fibrina, que é um componente essencial do mecanismo de coagulação do sangue. As mutações no gene da trombina são o segundo maior fator de risco para o desenvolvimento de trombose, ou coágulos sanguíneos profundos no interior dos vasos sanguíneos, ao lado da mutação do fator V.
Uma mutação no gene da trombina é congênita; portanto, uma pessoa pode ter uma ou duas cópias do gene mutado, com duas cópias colocando o indivíduo em um risco muito maior de trombose. A mutação no gene da trombina é uma mutação autossômica dominante, o que significa que uma pessoa com uma cópia da mutação tem 50% de chance de transmiti-la aos seus filhos. Tanto homens como mulheres, assim como pessoas de qualquer tipo sanguíneo, correm o mesmo risco de herdar esse gene e, se o fazem, têm um risco associado de trombose.
Essa mutação geralmente não é herdada com outras mutações e envolve uma mutação pontual na posição 20210 no gene da protrombina, localizada no 11º cromossomo. Cerca de 1-2% da população caucasiana é heterozigótica para a mutação do fator II, o que significa que essas pessoas têm uma cópia do gene defeituoso. A taxa de prevalência é muito menor em pessoas de outras origens raciais.
Quando essa mutação é herdada, ela diminui a degradação do RNA mensageiro da protrombina, aumentando assim a produção de protrombina, o que leva a uma maior quantidade de trombina no sangue. Por sua vez, o processo de coagulação pode ocorrer com muito mais facilidade devido ao excesso de trombina envolvido em uma cascata de criação de fibrina, que pode terminar em trombose. A mutação do gene da trombina aumenta o risco de trombose venosa profunda em cerca de duas a três vezes. Também existem outros riscos à saúde devido aos níveis elevados de trombina, particularmente ao aborto recorrente.
A mutação no gene da trombina aumenta o risco de trombose, mas isso não significa necessariamente que uma pessoa desenvolva esse distúrbio. Existem outros fatores de risco que podem aumentar as chances de trombose, principalmente com uma cópia mutada do gene. Esses fatores de risco incluem o uso de contraceptivos orais, herdando outra mutação genética conhecida como mutação do fator V, engravidar, fumar cigarros, obesidade ou permanecer imóvel por longos períodos de tempo.