A estrutura organizacional típica sem fins lucrativos é dividida em três categorias principais. As categorias incluem governança, administração e programas. Dentro dessas três divisões principais, também existem inúmeras subcategorias ou subdivisões que se enquadram em cada uma. O estado em que a organização sem fins lucrativos se registra também afeta a estrutura geral da organização.
A governança de uma estrutura organizacional sem fins lucrativos é o conselho de administração. O conselho de administração pode ser um grupo de pessoas que fazem parte do conselho ou dezenas de membros. Principalmente, o tamanho do conselho depende do tamanho e das necessidades da organização sem fins lucrativos. O tamanho do conselho também depende do estado em que a organização está sediada. O papel principal do conselho de administração é criar e aplicar as políticas da organização.
A segunda categoria principal de uma organização sem fins lucrativos é a administração. Embora o conselho de administração não seja uma equipe remunerada, mas simplesmente partes interessadas ou voluntários, a administração é remunerada. As duas subcategorias principais de funcionários ou administração são o diretor executivo ou presidente e a equipe. Obviamente, a equipe pode ser composta por vários funcionários.
Como a premissa de uma organização sem fins lucrativos é realizar um propósito específico, a área de programas de uma estrutura organizacional sem fins lucrativos trabalha para criar e implementar os programas que atendem a esse objetivo. Por exemplo, se a organização sem fins lucrativos é um museu de história, seu objetivo é narrar a história de sua área específica. Os programas podem incluir eventos sociais, oficinas e até passeios históricos pela região.
As áreas principais do programa incluem planejamento, captação de recursos, relações públicas, marketing, operações, coordenação voluntária, desenvolvimento e recursos humanos. Novamente, mesmo dentro dessas subcategorias de programas, existem subcategorias adicionais. O programa de marketing pode ser composto por um diretor de marketing, gerente de marketing e gerente de relações públicas. A área de captação de recursos pode ter um coordenador de banco de dados, diretor de associação e planejador de eventos.
As leis estaduais onde a organização sem fins lucrativos começou e opera também governam a estrutura organizacional sem fins lucrativos. Por exemplo, no Texas, uma organização sem fins lucrativos deve ter no mínimo três diretores que participem de seu conselho. O estado também exige uma pessoa que atue como presidente da organização, enquanto uma pessoa separada deve atuar como secretária do conselho e da organização. A lei estadual esclarece ainda que o presidente e o secretário não devem ser a mesma pessoa, mas sim duas pessoas separadas.
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