Diz-se que as isoflavonas têm vários benefícios, mas também têm alguns efeitos colaterais que podem ser incômodos e até perigosos para quem toma essa substância. Alguns efeitos colaterais das isoflavonas afetam principalmente as mulheres, porque as mulheres grávidas e aquelas que lutaram contra o câncer de mama geralmente correm o maior risco de sofrer efeitos negativos. Qualquer mulher, entretanto, pode ser afetada por ondas de calor e ganho de peso ao tomar isoflavonas. Os homens, por outro lado, podem notar uma redução da libido, infertilidade e perda de memória enquanto tomam suplementos de isoflavona. Outros efeitos colaterais das isoflavonas podem afetar mulheres e homens, sendo diarreia, alergias alimentares e dores de cabeça alguns dos problemas mais comuns.
Alguns efeitos colaterais são específicos para mulheres, porque as isoflavonas podem afetar o equilíbrio hormonal no corpo feminino, levando a algumas consequências negativas. Por exemplo, aquelas que têm histórico de câncer de mama geralmente são desencorajadas a tomar isoflavonas porque elas podem estimular as células do câncer de mama que já podem estar presentes. As isoflavonas também interferem nos medicamentos para o tratamento do câncer de mama, mas as mulheres sem histórico desse tipo de câncer geralmente são consideradas seguras contra esse possível efeito colateral. Uma preocupação adicional é que as isoflavonas podem ser prejudiciais para os bebês que ainda não nasceram, que precisam de um equilíbrio específico de hormônios para se desenvolver adequadamente no útero, então mulheres grávidas geralmente são aconselhadas a pular esse tipo de suplemento. Qualquer mulher é suscetível ao aumento de peso e ondas de calor que podem vir com as isoflavonas, portanto, as mulheres são aconselhadas a garantir que os possíveis benefícios superem os possíveis efeitos colaterais.
Os homens também podem sentir alguns efeitos colaterais das isoflavonas que as mulheres podem não ter, porque os dois geralmente têm equilíbrios hormonais diferentes. Um dos maiores efeitos colaterais em homens é a diminuição da libido, porque o aumento do estrogênio pode levar à diminuição dos níveis de testosterona, o que também pode resultar em infertilidade. Os efeitos colaterais adicionais para os homens podem incluir fadiga, perda de memória e diminuição da função cognitiva. Muitos estudos mostram que as mulheres não experimentam esses efeitos colaterais das isoflavonas, então os homens devem ter isso em mente antes de tomar essa substância, com base nas avaliações favoráveis das mulheres.
Alguns efeitos colaterais das isoflavonas afetam homens e mulheres. Algumas pessoas ficam constipadas enquanto tomam isoflavonas de soja, enquanto outras podem ter diarreia e dores de estômago. Dores de cabeça e sensação de tontura também são alguns dos efeitos negativos das isoflavonas. Também é possível que esta substância cause pedras nos rins, alergias alimentares e problemas de tireoide, portanto, as pessoas que decidirem tomar isoflavonas devem ficar atentas a esses efeitos colaterais.