Un motor interno es uno con solo una pequeña porción del eje de transmisión, junto con la hélice, sumergida en agua. Típicamente, en tales casos, la porción principal del motor del bote interno se encuentra dentro del bote, generalmente cerca del centro, especialmente en embarcaciones más pequeñas. Los motores de embarcación a bordo tienen algunas ventajas y desventajas cuando se trata de navegar por el agua.
En la mayoría de los casos, los motores intraborda son preferidos para el esquí acuático y quizás para el crucero en general. Por lo general, tardan menos en llegar a un avión y no hacen que la proa se eleve tanto como un fueraborda cuando llegan a ese avión. Esto también es ideal para los navegantes que se preocupan por esos pocos segundos cuando es posible que no puedan ver directamente lo que está frente a ellos. El motor interior lo hace posible porque no desperdicia tanta energía al elevar la parte delantera del barco.
Además, el motor intraborda es popular entre los esquiadores porque mantiene más del bote en contacto con el agua. Esto puede facilitar el despertar y una experiencia de esquí más fluida. Aún así, algunos esquiadores pueden preferir el desafío que viene con estelas más grandes y las prefieren para actividades como el salto en vela.
Sin embargo, algo también se da por vencido con un motor interno. El hecho de que esté tanto en contacto con el agua, al menos en comparación con los motores fuera de borda, significa que las embarcaciones experimentan sustancialmente más resistencia. Esto puede ralentizar el bote en comparación con los motores fueraborda de potencia similar. Por lo tanto, el motor interno puede no ser la mejor opción cuando la velocidad es una consideración importante.
Esta es solo una de las razones por las cuales los pescadores de torneos, como los que van tras el bajo u otras especies de peces de caza, prefieren los motores fuera de borda. Además, el bote a motor interno tiene una capacidad limitada para inclinar el eje de transmisión hacia arriba para llegar a aguas menos profundas donde a veces hay peces. Esto se compara con los motores fuera de borda que generalmente se pueden levantar por completo, o casi por completo, fuera del agua para acceder a dichas áreas.
Algunos afirman que los motores internos tienden a durar más que los motores externos. Sin embargo, esto puede explicarse como una preferencia personal o una cuestión de suerte. Los motores de dos tiempos tienden a desgastarse más rápidamente que los motores de cuatro tiempos y los motores interiores son principalmente motores de cuatro tiempos. Sin embargo, los fuerabordas modernos también son casi los cuatro tiempos, lo que hace que esta distinción ya no sea válida, al menos para los modelos más nuevos. Un motor interno también tiende a costar un poco más que un motor externo comparable, lo que puede dar a algunos la percepción de que la calidad es un poco mejor.