Une puce à ADN est une séquence de points d’ADN, de protéine ou de tissu disposés sur une puce pour une analyse simultanée facile. La plus connue est la puce à ADN, qui joue un rôle essentiel dans le profilage de l’expression génique. Le matériau du substrat est du verre, du plastique ou une puce de silicium. Les noms alternatifs pour la puce à ADN comprennent la puce génétique, la puce à ADN et la biopuce. Les petits morceaux d’ADN sont appelés sondes.
Une puce à ADN peut être fabriquée de différentes manières. Le plus primitif consiste simplement à déposer l’ADN sur des lames de verre à l’aide d’épingles. Des techniques plus sophistiquées utilisent la photolithographie, des approches électrochimiques et même l’impression à jet d’encre – tout ce qui peut livrer l’ADN à un endroit précis avec précision.
La puce à ADN est un produit de la fin des années 1980 et du début des années 1990, lorsque la biotechnologie a vraiment commencé à décoller. Le microréseau permet à un chercheur d’effectuer une séquence de tests sur tous les échantillons en même temps, accélérant ainsi considérablement la recherche. L’expérimentation biologique traditionnelle fonctionne sur les choses une à la fois. Les sondes sont parfois marquées de points appelés fluorofores lorsqu’elles ne peuvent pas être facilement distinguées.
Certaines des plus grandes puces à ADN, fabriquées par des sociétés telles que NimbleGen Systems, contiennent jusqu’à 390,000 XNUMX spots. Le microarray est fréquemment utilisé pour analyser l’ensemble du génome d’un organisme, qui peut contenir des dizaines de chromosomes ou plus, chacun avec son propre ADN et ARN. Malheureusement, toutes les puces à ADN ne sont pas compatibles les unes avec les autres et il y a un manque manifeste de normes. Des efforts de standardisation sont en cours, mais sans grand succès pour l’instant.
Comme la plupart des programmes de recherche en biotechnologie de pointe, les tests sur les puces à ADN peuvent produire d’énormes quantités de données, donnant naissance au domaine de la bioinformatique, qui cherche à donner un sens à tout cela. Il peut exister des découvertes et des corrélations que nous avons déjà mesurées, mais tout simplement pas remarquées en raison du débordement de données. L’exploration de données est largement utilisée pour analyser les résultats de ces expériences complexes.