Em uma clínica de hidroterapia do cólon, profissionais treinados, como os naturopatas, realizam procedimentos durante os quais o cólon é preenchido com líquido e drenado repetidamente para eliminar o material que se acumulou no cólon. Para fazer isso, um tubo é inserido no reto. O tubo fornece líquido para o cólon. Quando o cólon está se enchendo ou enchendo com o líquido, o terapeuta que administra o tratamento pode massagear o abdômen do cliente para auxiliar no processo de limpeza. O líquido usado para limpar o cólon é geralmente regulado em temperatura e pressão por uma máquina que também permite ao cliente ver o material que sai de seu cólon.
Para tornar o processo o mais confortável possível, uma clínica de hidroterapia do cólon geralmente oferece uma mesa acolchoada confortável para o cliente se deitar. A mesa geralmente se assemelha a uma mesa de massagem. Além disso, para tornar o processo de inserção do tubo no reto o mais confortável possível, a clínica geralmente tem lubrificantes naturais ou sintéticos à mão que são usados para revestir a extremidade do tubo. Esses lubrificantes podem incluir óleo de coco virgem ou lubrificantes que são usados para aumentar o prazer sexual.
É comum uma clínica de hidroterapia do cólon oferecer alguns tipos de líquidos que podem ser usados para limpar o cólon. O líquido mais básico que pode ser usado é água purificada. Algumas pessoas optam por usar água que foi infundida com ervas, enquanto outras optam por usar café para limpar seus dois pontos. Uma clínica de hidroterapia do cólon também pode oferecer um cólon que envolve o uso de água que foi infundida com alho. Os clientes também podem pedir ao terapeuta que ajuste a temperatura e a pressão do líquido durante a sessão para tornar a experiência o mais confortável possível.
Embora os clientes devam tirar as roupas da metade inferior de seus corpos para se submeter às sessões de hidroterapia do cólon, uma clínica de hidroterapia do cólon geralmente trabalha muito para que os pacientes se sintam o mais relaxados possível. Antes da sessão de hidroterapia, o cliente recebe a sala de terapia para se despir conforme necessário e deitar sob um cobertor, lençol ou toalha. O terapeuta que administra a sessão geralmente pode completar a maior parte da sessão sem que o cliente tenha que descobrir as áreas privadas da metade inferior de seu corpo.