Dependendo da gravidade do distúrbio, várias opções de tratamento diferentes estão disponíveis para pacientes com sistema nervoso autônomo hiperativo. Essa condição pode ser causada por outro distúrbio, como alcoolismo ou diabetes e, quando possível, o tratamento dessas doenças pode curar completamente os problemas do sistema nervoso autônomo. Para os casos que aparecem espontaneamente, não há cura, embora existam mudanças no estilo de vida e medicamentos que podem ajudar os pacientes a lidar com os efeitos adversos desses distúrbios. O tipo de tratamento usado geralmente depende da gravidade dos sintomas.
Em alguns casos, um paciente pode desenvolver um sistema nervoso autônomo hiperativo porque tem outro problema médico. Sabe-se que o alcoolismo perturba o funcionamento desse sistema e, nesse caso, o tratamento envolveria evitar o álcool e dar ao corpo tempo para se curar dos danos causados pelo excesso de bebida. Pacientes com diabetes também podem ter problemas com o sistema nervoso autônomo e, embora essa doença não possa ser curada, administrá-la bem pode eliminar muitos dos sintomas. Alguns tipos de infecções virais também podem causar distúrbios do sistema nervoso autônomo, que podem desaparecer por conta própria assim que a infecção for suprimida.
Em muitos casos, entretanto, não é possível curar um sistema nervoso autônomo hiperativo. Pacientes com certas doenças genéticas; doenças degenerativas, como doença de Parkinson; ou lesões que danificaram as partes do cérebro que controlam o sistema nervoso autônomo podem ter que controlar esse distúrbio por toda a vida. Em casos leves que afetam o paciente apenas de forma intermitente ou que aumentam ligeiramente a pressão arterial e a frequência cardíaca, o paciente pode ser capaz de controlar os sintomas com técnicas de redução do estresse. Uma dieta adequada, um alto nível de preparo físico e uma visão positiva da vida podem ajudar a acalmar o paciente e diminuir o fluxo de adrenalina que causa uma reação exagerada do sistema. A respiração profunda e a meditação também são úteis, especialmente quando o paciente está sofrendo de um ataque.
Os casos mais graves podem exigir o uso de medicamentos ou outra intervenção médica. Alguns medicamentos podem ser usados para reduzir a pressão arterial e a frequência cardíaca, enquanto outros podem ajudar o paciente a se sentir menos ansioso. Os procedimentos cirúrgicos que permitem que o coração bata normalmente também podem estar disponíveis para pacientes com problemas graves que afetam o ritmo cardíaco.