As glândulas exócrinas e endócrinas, embora parecidas em alguns aspectos, servem a propósitos diferentes no corpo. As glândulas exócrinas secretam muco ou proteína para a parte externa do corpo, enquanto as glândulas endócrinas secretam hormônios no sangue. As várias substâncias produzidas pelas glândulas exócrinas são frequentemente usadas para lubrificar vários sistemas, livrar o corpo de microorganismos nocivos ou ajustar a temperatura do corpo. As secreções endócrinas, por outro lado, são geralmente usadas no complexo sistema de comunicação do corpo e podem causar uma variedade de alterações na química do corpo. Embora as glândulas exócrinas e endócrinas sejam usadas em uma variedade de processos corporais, apenas as glândulas endócrinas são capazes de se comunicar com sistemas distantes no corpo.
Uma das principais diferenças entre as glândulas exócrinas e endócrinas é a sua localização no corpo. Na maioria das vezes, as glândulas exócrinas estão localizadas perto da superfície da pele ou nas cavidades do corpo que levam à parte externa do corpo, como olhos, nariz, boca ou órgãos sexuais. O sistema digestivo também abriga glândulas exócrinas que podem ser encontradas ao longo de todo o seu comprimento. As glândulas endócrinas, por outro lado, são frequentemente encontradas nas profundezas do corpo. A glândula adrenal, localizada no topo dos rins, e a hipófise, encontrada no cérebro, são duas das glândulas mais conhecidas do sistema endócrino.
Outra diferença entre as glândulas exócrinas e endócrinas é o seu objetivo. Muitas das glândulas exócrinas produzem muco, uma substância viscosa feita de glicoproteínas e água, usada para lubrificar órgãos como os olhos e o esôfago e para capturar substâncias nocivas que tentam entrar no corpo através das membranas mucosas. Algumas dessas glândulas secretam proteínas que podem ajudar na digestão. As glândulas exócrinas próximas à superfície da pele liberam o suor, substância usada para resfriar o corpo se a temperatura interna ficar muito alta.
As glândulas endócrinas secretam hormônios que controlam muitos dos processos no corpo. A hipófise é responsável pelo crescimento e maturidade sexual, além de vários outros processos. Quando uma pessoa é colocada em uma situação perigosa, as secreções da glândula adrenal instruem o coração a bater mais rápido e a pressão sanguínea a subir, em preparação para lutar ou fugir do perigo. Essas e outras glândulas do sistema endócrino liberam hormônios na corrente sanguínea de uma pessoa, enviando mensagens que podem ser recebidas por todo o corpo.