Si bien muchos corredores sienten los beneficios de correr descalzo de inmediato, otros corredores pueden no estar convencidos de que la práctica es segura o beneficiosa, por lo que el debate tiende a continuar. Algunos estudios han concluido que los beneficios de correr descalzo incluyen menos estrés en los pies y las piernas, mientras que otros dicen que los beneficios son insignificantes o incluso inexistentes. El pie tenderá a moverse más naturalmente cuando corra descalzo en lugar de correr con un zapato acolchado, lo que puede reducir el riesgo de lesiones en los tejidos blandos o incluso fracturas en el pie.
Quizás el beneficio más significativo de correr descalzo es el impacto reducido que soportan los corredores descalzos. Las personas que corren con zapatos acolchados tienden a aterrizar con el talón primero durante la zancada, lo que significa que se transfiere una cantidad significativa de fuerza a los pies y las piernas. Sin embargo, los corredores descalzos tienden a aterrizar sobre las puntas de los pies, lo que amortigua el impacto más a fondo y evita que la misma cantidad de fuerza se transfiera a los pies y las piernas. Los beneficios de correr descalzo en este caso significan menos potencial de lesiones y una menor aparición de fatiga prematura.
Correr con zapatillas acolchadas puede debilitar el pie al proporcionar un apoyo excesivo en el arco y el talón. Un pie más débil significa una mayor probabilidad de lesión, especialmente en el pie y el tobillo. Uno de los beneficios de correr descalzo es la capacidad de fortalecer los músculos, tendones, ligamentos e incluso el cartílago presente en todo el pie, lo que reduce la probabilidad de lesiones y puede aumentar la movilidad y la estabilidad de los pies y las piernas. Sin embargo, la transición entre correr con zapatos y correr descalzo debe hacerse con cuidado y gradualmente, ya que el pie debilitado no se utilizará en el nuevo entorno. Es posible que sea necesario ajustar la marcha del corredor para que caiga sobre las puntas de los pies cuando corre en lugar de hacerlo sobre los talones.
Una posible desventaja de correr descalzo es la exposición a los elementos, así como a terrenos irregulares o incómodos. Incluso después de que se desarrollen callosidades en los pies, el corredor correrá el riesgo de sufrir heridas punzantes por escombros esparcidos en el suelo, lo que a su vez puede provocar infecciones como el tétanos. Atropellar varios tipos de escombros también puede ser incómodo para algunos corredores, y existe un mayor riesgo de otras lesiones, como dedos de los pies golpeados que pueden provocar fracturas. Se han desarrollado zapatos especiales sin amortiguación con ranuras individuales para los dedos de los pies para permitir el movimiento natural del pie al tiempo que proporciona cierta protección contra los escombros.