Existen varios tipos de enzimas del sistema digestivo, cada uno diseñado para descomponer diferentes partes de los alimentos, que se pueden encontrar en diferentes puntos del sistema digestivo. Las principales categorías de enzimas son amilasa, lipasa, proteasa y nucleasa. Las glándulas en la boca, el estómago, el intestino delgado y el páncreas segregan algunos o todos estos a medida que los alimentos pasan a lo largo del tracto digestivo para que el cuerpo pueda descomponerlos y utilizarlos. La mayoría de las enzimas digestivas se encuentran en el jugo pancreático, aunque también están presentes en la saliva y los jugos digestivos gástricos.
Una de las primeras enzimas en iniciar el proceso de digestión es la amilasa. Este tipo de enzima está diseñada para descomponer los carbohidratos en azúcares simples que el cuerpo puede procesar. Primero es secretada en la boca por las glándulas salivales, donde comienza a digerir alimentos como frutas, verduras y frijoles. Luego, el páncreas produce más amilasa y se envía al intestino delgado, donde continúa ayudando a descomponer los carbohidratos. Existen varias subcategorías de amilasa, cada una diseñada para procesar ciertos tipos de carbohidratos; por ejemplo, la lactasa descompone los azúcares de la leche y la sacarasa descompone los almidones y azúcares complejos.
La proteasa es el grupo de enzimas del sistema digestivo que descompone las proteínas contenidas en carnes, nueces y quesos. El estómago y el páncreas crean proteasa, por lo que el procesamiento de proteínas comienza más en el sistema digestivo que los carbohidratos. La proteína necesita descomponerse en aminoácidos, que son críticos para que todas las células funcionen. Los principales tipos de proteasa que se encuentran en el cuerpo humano son la pepsina y la peptidasa.
Otra de las enzimas del sistema digestivo es la lipasa. La función de la lipasa es descomponer las grasas, como las que se encuentran en los aceites, la carne y los lácteos. Se genera algo de lipasa en la boca y el estómago, pero la mayor parte proviene del páncreas y hace su trabajo en el intestino delgado. Aquí funciona con la bilis, generada por el hígado, que emulsiona las grandes moléculas de grasa, haciéndolas más pequeñas para que la lipasa pueda descomponerla aún más en glicerol y ácidos grasos.
El páncreas también genera las enzimas finales del sistema digestivo, la nucleasa. Esta enzima está hecha para descomponer ácidos nucleicos como el ADN y el ARN. Actúa para separar los enlaces entre los nucleótidos, que luego liberan nitrógeno y azúcares simples.