O principal problema de saúde associado ao guano de morcego é a histoplasmose. Essa doença transmitida pelo ar se origina em um fungo que vive em fezes de morcego. Pode afetar o sistema respiratório de qualquer ser humano que respire o ar que foi exposto a ele. O corpo é normalmente capaz de lutar contra esta doença, no entanto, os indivíduos com um sistema imunológico comprometido podem necessitar de medicamentos para o tratamento.
Os morcegos costumam escolher se empoleirar nos sótãos e abrir as vigas das casas e celeiros. Eles dormem durante o dia, caçam à noite e podem criar ninhos extensos ao acasalar e gerar filhotes após algumas temporadas. O guano de morcego que eles deixam para trás, tanto dentro das áreas superiores da casa quanto no solo externo, é muito tóxico para os humanos se perturbado.
A histoplasmose pode viver em cima de guano de morcego ou em solo que foi exposto a fezes. Quando o guano é agitado de alguma forma, o fungo rapidamente se espalha pelo ar. Pode circular no ar respirável de uma casa ou edifício e infectar os pulmões de qualquer pessoa que o inale.
A doença normalmente requer um período de cerca de dez dias para germinar e começar a evidenciar os sintomas. As pessoas que sofrem de dores tendem a se queixar de febre, dores no peito, tosse, dor de cabeça e perda de apetite. O sistema imunológico do corpo geralmente é capaz de lutar contra a doença e experimentar uma recuperação completa em questão de várias semanas. Aqueles com sistema imunológico comprometido, como indivíduos que já estão doentes de outra doença ou foram infectados com AIDS, podem precisar de tratamento, incluindo medicamentos e hospitalização.
Muitos países, incluindo os EUA, protegem os morcegos como espécie em extinção e não permitem que sejam exterminados durante o processo de remoção. Os proprietários podem entrar em contato com um exterminador profissional que pode remover completamente a infestação sem matar os animais. Eles devem selar imediatamente todas as aberturas restantes no sótão ou vigas da casa, uma vez que isso tenha sido concluído, para evitar que os animais voltem. Alguns desses serviços também cobram uma taxa para a retirada dos dejetos dos animais.
O guano de morcego só é tóxico se for perturbado e se dissipará por conta própria inofensivamente no ar se não for tocado depois de dois ou três anos. Se a infestação ocorreu em uma parte da casa que pode ser isolada dos ocupantes, ou em um prédio anexo raramente usado, então pode ser benéfico não remover os excrementos. A maioria dos casos de doenças decorrentes da exposição a esse tipo de resíduo ocorre após a limpeza e remoção de um ninho ou solo próximo a um ninho. Se um proprietário preferir limpar a área, ele deve usar uma máscara facial que possa filtrar partículas tão pequenas quanto um milimícron. Ele deve usar um aspirador com filtro de ar de alta eficiência para remover os resíduos e descartá-los imediatamente em um saco de lixo lacrado.