Se ha dicho a generaciones de bebedores de café que reduzcan la cantidad de café que consumen basándose en el supuesto de que es malo para su salud. Gran parte del estigma sobre el café se ha basado en gran medida en la alta cantidad de cafeína en la bebida. La investigación ha demostrado, sin embargo, que también podría haber algunos beneficios para la salud del café cuando se consume con moderación: de tres a cuatro tazas al día. Existe preocupación por el exceso de café que causa un aumento de la frecuencia cardíaca, pero algunos investigadores creen que los beneficios para la salud del café podrían superar los riesgos. Algunos de los beneficios para la salud del café pueden incluir un menor riesgo de cáncer, diabetes, enfermedad de Parkinson y enfermedad de cálculos biliares, así como una mayor tasa de metabolismo
La investigación ha demostrado que el café podría tener propiedades anticancerígenas. Algunos estudios indican que el riesgo de cáncer de hígado se reduce en un 50 por ciento. La investigación también muestra cierta correlación en la reducción de otros cánceres, como el cáncer de colon y de mama.
Se cree que los beneficios para la salud del café para la diabetes son dobles. La investigación ha demostrado que podría reducir el riesgo de diabetes hasta en un 50 por ciento. Otro efecto del café es aumentar la tasa de metabolismo en reposo y posiblemente disminuir el recuento de azúcar en la sangre. Esto puede mejorar la salud de los diabéticos, así como prevenir la aparición de esta enfermedad en las personas no afectadas.
También se cree que el café desempeña un papel en la protección de los hombres contra la enfermedad de Parkinson, y los bebedores regulares de café tienen menos probabilidades de sufrir los síntomas de la enfermedad de cálculos biliares. Esto podría deberse a que el café altera el contenido de colesterol de la bilis producida por el hígado.
A pesar de la evidencia de que el café tiene algunos beneficios para la salud, los expertos no están de acuerdo sobre si esos beneficios superan los riesgos. Entre los efectos negativos del café, especialmente cuando se consume en grandes cantidades, se cree que se encuentra el aumento de la presión arterial y la frecuencia cardíaca, un latido cardíaco irregular, adicción, ansiedad, irritabilidad e insomnio. Además, algunos estudios han demostrado una conexión entre el café y la enfermedad cardiovascular, indigestión, acidez estomacal, osteoprosis en mujeres posmenopáusicas y síntomas empeorados del síndrome premenstrual (PMS). La investigación también sugiere que el café podría reducir la fertilidad en las mujeres que intentan concebir.