El camino espiritual Siddha Yoga se basa esencialmente en la filosofía que se centra en el ser interno que puede acercarnos a Dios. Se basa en gran medida en el shaivismo de Cachemira y las tradiciones espirituales hindúes de Vedanta. Siddha Yoga es presentado por sus practicantes como una espiritualidad individual que a menudo se desarrolla en una comunidad de creyentes. Dependiendo de la percepción individual de la organización, generalmente se le conoce como un nuevo movimiento religioso o un culto.
Siddha Yoga es una combinación de práctica diaria y enseñanzas impartidas por un gurú. Las enseñanzas incluyen instrucción sobre las filosofías básicas del autodescubrimiento, el servicio a los demás y la adhesión a las tradiciones bíblicas de la religión hindú. La práctica incluye meditación, canto y escuchar música sagrada. Estas actividades se realizan típicamente en centros de meditación y retiros, aunque algunas actividades diarias también se pueden practicar en casa.
Un estudiante nuevo en Siddha Yoga generalmente se iniciará espiritualmente con una práctica conocida como shaktipat diksha. Este es un proceso por el cual el gurú recibe a un estudiante dispuesto con un gesto simbólico, como un toque, un mantra o una palabra sagrada. De esta manera, se cree que el gurú ha penetrado y ha entrado en el espíritu del estudiante. Algunos seguidores del método han descrito este proceso como el aura del gurú que envuelve al estudiante.
Swami Muktananda Paramahamsa fundó Siddha Yoga en India, bajo la guía de su maestro espiritual Bhagawan Nityananda. Finalmente abrió varios centros de meditación en todo el mundo. Ha habido centros en Japón, Estados Unidos, Gran Bretaña, Australia y Francia, entre muchas otras naciones. El movimiento ha tendido a centrarse en los ashrams más grandes de Nueva York y Ganeshpuri, India. Tras la muerte de Swami Muktananda en 1982, su discípulo Gurumavi Chidvilasanada, originalmente conocido como Malti Shetty, asumió el liderazgo espiritual del movimiento Siddha Yoga.
Ha habido controversia sobre las acciones de algunos gurús de Siddha Yoga y del movimiento en general. William Rodarmor en 1983 y Lis Harris en 1994 plantearon dudas sobre la práctica en varios artículos publicados. Desde 1996, el sitio web Leaving Siddha Yoga también ha mantenido una voz muy crítica sobre el movimiento y sus líderes. Las acusaciones contra el movimiento han incluido abuso sexual, control mental y luchas internas perturbadoras e inapropiadas entre los gurús y sus asociados. También ha habido perfiles principalmente positivos del movimiento en artículos en varias revistas populares.