Para cada tipo de cultivo que un agricultor quiere cultivar orgánicamente, sin la ayuda de fertilizantes químicos o pesticidas, se presenta un conjunto diferente de dificultades. Es probable que producir un rendimiento rentable de papas orgánicas, por ejemplo, requiera más tiempo y dinero gastado antes del mercado y un precio más alto en el puesto de productos que aquellos cultivados con medios convencionales. La recompensa son las verduras que carecen de toxinas potencialmente dañinas para las personas y sus tierras.
El Centro de Sistemas Agrícolas Integrados de la Universidad de Wisconsin descubrió durante un estudio realizado en 1990 con papas orgánicas que aquellos cultivados con pesticidas químicos, herbicidas y fertilizantes, así como semillas genéticamente modificadas, tenían mayores rendimientos y menores costos. En un año, las granjas convencionales en el estudio produjeron aproximadamente 32,800 libras. (casi 15,000 kg) por acre de papas, mientras que las granjas orgánicas produjeron aproximadamente 21,200 lbs. (casi 10,000 kg) por acre. Además, las granjas de papa orgánica eran un poco más caras de operar, con precios promedio de $ 1,074 dólares estadounidenses (USD) por acre, en comparación con $ 928 (USD) por acre para granjas convencionales. Para competir, UW señaló que los agricultores orgánicos tuvieron que aumentar los precios dramáticamente para justificar su trabajo.
El costo y el tiempo adicionales asociados con el cultivo de papas orgánicas involucra varios factores. En lugar de usar fertilizantes químicos o herbicidas para calmar las enfermedades de la papa, los agricultores deben plantar en los campos que produjeron maíz o alfalfa el año anterior para evitar ciertas enfermedades. Los agricultores deben recoger las malezas a mano o usar remedios no químicos que eliminen las malezas, en lugar de cortar las malezas con herbicidas.
Quizás la mayor amenaza para las papas orgánicas son las muchas plagas atraídas por ellas. Por lo general, los agricultores usarán insecticidas potencialmente dañinos para alejar a los insectos más atraídos por las plantas. Según el Departamento de Entomología de la Universidad de Kentucky, estos errores se pueden dividir en dos motivos. Las amenazas sobre el suelo son los pequeños pulgones, saltahojas y escarabajos de la patata. Debajo del suelo están los gusanos blancos igualmente devastadores y los gusanos de alambre marrón. Estas son solo las amenazas más frecuentes en esa parte del mundo.
Las papas orgánicas requieren fertilizantes especiales, insecticidas, manejo de la humedad y rotación de cultivos para producir un rendimiento comercializable. Es probable que esto también signifique más tiempo dedicado a erradicar plagas y enfermedades. Sin embargo, el mayor costo en el mercado se traduce en un suelo más saludable en el que se cultivan las plantas, y en un alimento más saludable en la mesa.