Os efeitos dos antibióticos na menstruação não são totalmente certos, embora algumas pesquisas tenham sido realizadas no passado na tentativa de determinar se os antibióticos afetam o ciclo menstrual. Muitas mulheres que tomam antibióticos não notam diferenças em seus ciclos menstruais, enquanto outras mulheres notam mudanças que presumem ser resultado do uso de antibióticos. Os possíveis efeitos dos antibióticos na menstruação podem não estar relacionados aos antibióticos em si, mas sim às infecções para as quais os antibióticos são usados. Algumas mulheres pensam que os antibióticos causam sangramento mais intenso, início da menstruação retardada e cólicas mais graves do que o normal, mas esses problemas podem ser causados por infecções, especialmente se as infecções envolverem o sistema reprodutor feminino.
No final dos anos 1940, dois médicos especialistas britânicos fizeram um estudo sobre os efeitos da penicilina, que é um tipo de antibiótico, em várias mulheres para ver como ela afetava seus ciclos menstruais, se é que afetava. Seus resultados foram inconclusivos, embora várias mulheres que participaram do estudo relataram algumas mudanças, incluindo cólicas graves e sangramento mais intenso do que o normal. Algumas mulheres também notaram diferenças em quando a menstruação começou e quanto tempo durou. Embora muitas mulheres tenham notado diferenças, muitas mulheres não notaram, e pode ser por isso que o estudo não revelou muito sobre os efeitos dos antibióticos na menstruação.
Existem várias infecções que ocorrem no sistema reprodutor para as quais os antibióticos podem ser usados para tratar, e essas infecções podem causar alterações na menstruação. Algumas coisas para as quais os antibióticos são ocasionalmente usados em mulheres incluem infecções vaginais e infecções uterinas. Antibióticos também são prescritos ocasionalmente para certos tipos de infecções por fungos. As mulheres que notam mudanças em seus ciclos menstruais que têm infecções dentro de seus sistemas reprodutivos provavelmente estão experimentando mudanças por causa da natureza de suas infecções, e não pelos próprios antibióticos.
Embora os efeitos dos antibióticos na menstruação estejam mais do que provavelmente relacionados a diferentes tipos de infecções, e não aos antibióticos, qualquer alteração incomum deve ser relatada a um médico. Sempre existe uma chance de que certos antibióticos possam causar alterações dentro do corpo que podem afetar o ciclo menstrual. Se as mudanças no ciclo forem muito incomuns e graves, o médico pode ajudar. Se um médico suspeitar que os antibióticos estão causando problemas com a menstruação, ela provavelmente tentará encontrar outro antibiótico para prescrever, ao qual sua paciente pode não ser tão sensível.