Minnesota é um dos estados mais ao norte da região Centro-Oeste dos EUA. Foi admitido como o 32º estado em 1858. Embora Minnesota tenha adotado um selo estadual em 1861, não havia bandeira estadual de Minnesota até 1893. O ímpeto para criar uma bandeira estadual parece ter sido a próxima Exposição Colombiana Mundial de 1893, que foi a ser realizada em Chicago, Illinois, nos Estados Unidos. Todos os estados dos EUA, que na época eram apenas 44, foram convidados a apresentar e expor sobre seu estado na exposição, e Minnesota se viu sem uma bandeira estadual.
Uma comissão foi nomeada pela legislatura de Minnesota, que patrocinou um concurso de desenho de bandeiras aberto aos residentes do estado. A inscrição vencedora foi enviada por Amelia Hyde Center, residente de Minneapolis, e usou o selo do estado como o emblema central da bandeira. O design de Hyde para a bandeira incluía cores diferentes – azul e branco & mddash; em cada lado.
O selo do estado de Minnesota mostra um fazendeiro arando seu campo, que fica próximo a um riacho e uma pequena cachoeira. Um campo verde aberto está próximo, e o sol nasce nas colinas e árvores ao longe. O rifle do fazendeiro está apoiado em um toco de árvore atrás dele. Ele observa enquanto um nativo americano cavalga segurando uma lança e olha para ele. Uma fita no selo diz L’Étoile Du Nord, em francês para A Estrela do Norte.
Na primeira bandeira do estado de Minnesota, havia três datas históricas importantes em torno do selo: 1819, 1858 e 1893. Em 1819, Fort Snelling, um importante posto militar avançado para a proteção de novos colonos foi fundado. O ano de 1858 marca a admissão de Minnesota à condição de estado e 1893 é o ano do desenho da bandeira.
O selo é envolto em flores de mocassim brancas em um campo azul. Duas fitas fluem de baixo do selo e emolduram o nome do estado. Em torno do selo, 19 estrelas em pequenos aglomerados formam as cinco pontas de uma estrela maior. A maior estrela da bandeira representa Minnesota. O desenho da bandeira foi costurado em seda por duas irmãs imigrantes norueguesas, Thomane e Pauline Fjelde, e a bandeira do estado de Minnesota recebeu uma medalha de ouro pelos bordados na exposição.
O projeto original do Center sofreu algumas alterações. Em 1957, a legislatura mudou a bandeira do estado de Minnesota para uma bandeira unilateral, em grande parte com base em considerações de produção e custo. A legislatura de Dakota do Sul tomou uma decisão semelhante em relação à bandeira bilateral de seu estado em 1963, pelas mesmas razões. Durante as mudanças de 1957, flores de sapatinho rosa e brancas, nativas de Minnesota, substituíram as flores de mocassim branco na coroa em torno do selo estadual.