Hay varios ingredientes diferentes para cupcakes disponibles, algunos muy tradicionales y otros muy complejos y únicos. Para una cobertura dulce y estándar, la crema de mantequilla o el glaseado real son populares. Cuando se decora de manera elaborada, el mazapán se puede cortar para que coincida con la superficie y apilarlo al grosor deseado para sostener las figuras de plástico o azúcar. La crema batida, las conservas de frutas, el chocolate derretido o las salsas hechas de nueces se pueden usar como ingredientes para cupcakes. Se pueden hacer coberturas simples simplemente espolvoreando la superficie de la magdalena con un poco de azúcar en polvo, cacao en polvo o cuentas azucaradas de colores.
Uno de los ingredientes más conocidos para los cupcakes es el glaseado de crema de mantequilla. Esto se hace simplemente con mantequilla que se ha batido hasta que se haya batido y luego se ha mezclado con azúcar. Es versátil y puede ser aromatizado con vainilla, chocolate o licor y coloreado con unas gotas de colorante alimentario. Puede proporcionar un rico y cremoso sabor a los pastelitos que lo acompañan.
El glaseado real, que es un glaseado a base de azúcar que se seca en un estado azucarado sólido, se puede usar para hacer una corteza crujiente encima de los pastelitos. Al igual que la crema de mantequilla, puede ser aromatizada y coloreada para adaptarse a la situación. El glaseado a menudo se usa con mazapán, una lámina maleable de pasta de almendras y azúcar, porque el mazapán puede crear una superficie plana y limpia y el glaseado real puede hacer patrones sólidos y decoraciones encima.
Para ciertos eventos, se pueden hacer coberturas especiales para cupcakes a partir de dulces normales y colocarlos sobre una base de glaseado. Esto puede incluir rizos de chocolate afeitado o trozos de fruta que se han sumergido en almíbar simple para darles un aspecto brillante. Se pueden colocar hojuelas de chocolate blanco, avellanas ralladas o caramelos prefabricados o chispitas de decoración en la parte superior para un sabor extra.
También hay moldes disponibles que pueden llenarse con chocolate derretido o azúcares de colores que crean diseños tridimensionales (3D) como mariposas, flores o estrellas que pueden usarse como ingredientes extravagantes para cupcakes. Se pueden tallar y colocar diferentes tipos de fruta, como manzanas y peras, para hacer figuritas pequeñas y comestibles. Cualquier sustancia dulce, como el chocolate o el glaseado real, que se pueda rociar como líquido antes de que se endurezca, se puede usar en papel encerado para crear formas delicadas y sólidas que se pueden sacar del papel y colocar encima de un pastelito que ha sido escarchado.
Los alimentos que se pueden moler también se pueden convertir en ingredientes para cupcakes rociándolos sobre las partes superiores esmeriladas. Las almendras molidas o los cacahuetes, las galletas de chocolate trituradas o las galletas Graham funcionan bien. Para una cobertura más elaborada, una salsa espesa hecha de frutas reducidas con salsa de caramelo puede agregar dulzura y textura a la magdalena.