Ci sono diversi passaggi coinvolti nella pulizia dei funghi portobello, non tutti sono necessari o talvolta desiderabili. Gli steli hanno una consistenza molto legnosa e, se tagliati, possono essere tagliati a cubetti finemente e fritti o congelati per un uso successivo in brodo vegetale. Le branchie non devono sempre essere rimosse ma possono essere facilmente raschiate con un cucchiaio. La parte superiore del tappo a fungo, che di solito è un colore brunastro, può essere rimossa con cura in modo che il portobello abbia un aspetto pallido e pulito quando presentato. Nessuno dei metodi di pulizia è veramente necessario, ad eccezione della rimozione delle branchie se il fungo è invecchiato troppo e le branchie hanno acquisito un cattivo odore.
Un’area di confusione sulla pulizia dei funghi portobello è se lavarli in acqua. Mentre i funghi assorbiranno una piccola quantità di acqua, non è in realtà una quantità abbastanza significativa da influire sul sapore a meno che il fungo non venga affettato o immerso per lungo tempo. Il motivo principale per evitare di immergere i funghi in acqua è che la superficie del fungo verrà danneggiata, rovinandone l’aspetto se non vengono utilizzati molto presto dopo essere stati lavati. Quando si puliscono i funghi portobello che non verranno utilizzati fino a poche ore o giorni dopo, è meglio usare solo un panno umido per rimuovere lo sporco sulla superficie.
Le branchie sotto il cappuccio di un fungo portobello vengono spesso rimosse perché causano un colore scuro del cibo, anche se le branchie sono perfettamente commestibili e possono aggiungere un sapore terroso a un piatto. Si rimuovono facilmente tenendo il fungo capovolto e raschiandolo con la punta di un cucchiaio. Se le branchie si sono aperte e hanno un odore sgradevole, dovrebbero sicuramente essere rimosse. Bisogna fare attenzione quando si puliscono i funghi portobello dalle branchie, perché possono ancora scurire taglieri o altri alimenti se vengono a contatto con loro, anche se di solito questi possono essere lavati via se presi abbastanza presto.
Anche la superficie sulla parte superiore del cappuccio del fungo può essere rimossa. La pelle sottile può essere strappata a strisce, di solito afferrando un pezzettino sul bordo esterno del cappuccio e tirando verso l’alto. Può funzionare anche una spazzola per la pulizia dei funghi o una spazzola per verdure. Il motivo principale per rimuovere la pelle quando si puliscono i funghi portobello è creare una presentazione uniforme quando vengono utilizzati in insalate o salse bianche.